그러나 전국교직원노동조합(전교조) 등 학교 통폐합에 반대해온 단체들은 이번 조처에 대해 “농·산·어촌의 현실을 제대로 반영하지 않았다”며 부정적인 반응을 보였다. 노경석 전교조 경남지부 남해지회장은 “통학버스가 생겨도 여러 마을을 경유해 갈 수밖에 없기 때문에 통학시간이 늘어나 학생들에게 큰 부담이 될 것”이라며 “남해의 경우 병설유치원이 대부분 원아수 10명 이하의 소규모인데, 이를 모두 통폐합한다면 유치원생들이나 부모들의 고통이 커질 것”이라고 말했다. 그는 “오히려 시골의 작은 학교는 이상적인 교육환경으로 볼 수 있는 측면도 있기 때문에 이를 살리면서 부족한 부분을 보완하는 방향으로 가야 한다”고 지적했다.